O Γιαννόγκωνας καταδικάστηκε για το αδίκημα της διατάραξης κοινής ειρήνης από κοινού, σε επίθεση τάγματος εφόδου της ναζιστικής οργάνωσης στην Πετρούπολη την 8 Οκτωβρίου 2011.
Όπως αναφέρει η Πολιτική Αγωγή στη δίκη της Χρυσής Αυγής: «Ο Μιχάλης Γιαννόγκωνας είχε καταθέσει στον Άρειο Πάγο το 2014 καταστατικό ίδρυσης νέου κόμματος με την επωνυμία «Εθνική Αυγή», σε περίπτωση μη νομιμοποίησης του συνδυασμού της Χρυσής Αυγής λόγω της ποινικής δίωξης για εγκληματική οργάνωση.